2001-ben Trulli hat ponttal meg tudta verni Frentzent és ez 12 pontot és a pontverseny 7. helyét jelentette számára.

Trulli menedzsere ebben az időben honfitársa, Flavio Briatore volt, aki egyben a Renault csapatfőnökeként is tevékenykedett. 2002-ben Briatore a francia istállóhoz vitte védencét, ahol Jenson Button lett a csapattársa. Trulli 9 pontot gyűjtött és nyolcadik lett ebben a szezonban, míg Button 14 ponttal a hetedik helyen végzett. Ennek ellenére Trulli maradt a csapatnál 2003-ban is, míg Button helyére az addigi tesztpilóta – és Briatore másik védence-, Fernando Alonso került.

2003-ban Alonso jobban szerepelt Trullinál: az ifjú spanyol Malajziában megszerezte pályafutása első pole pozícióját (Trulli második volt mögötte), majd a Hungaroringen első futamgyőzelmét is. Trulli legjobb eredménye hockenheimi harmadik helye volt. Az olasz 33 ponttal a világbajnokság nyolcadik helyén végzett, míg Alonso 55 ponttal a hatodikon.

A Renault-tól való távozása után Trulli kihagyni kényszerült a Kínai Nagydíjat, de a soron következő Japán Nagydíjon már a Toyota autójában ült. Az olasz versenyző korábban megállapodott a japán gyárral arról, hogy 2005-től náluk fog versenyezni, s a Toyota már 2004-ben hajlandó volt megadni Trullinak a lehetőséget.

2005-ben Ralf Schumacher lett Trulli csapattársa, akit az olasz versenyző a szezon elején rendszeresen maga mögé tudott utasítani.

2006-ban Trulli továbbra is Ralf Schumacherrel együtt alkotja a Forma-1-es Toyota csapat versenyzőpárosát.